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實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)LIMS的發(fā)展


    LIMS自誕生之日起到如今已經(jīng)歷了20多年的發(fā)展。尤其是近七、八年來(lái)計(jì)算機(jī)的普及和IT技術(shù)的爆炸性發(fā)展,以及生命科學(xué)領(lǐng)域所取得的舉世矚目的成果,對(duì)LIMS技術(shù)起到了巨大的推動(dòng)作用。如今的LIMS早已經(jīng)不再局限于傳統(tǒng)意義上的樣品管理、人員管理、儀器管理和報(bào)告打印等簡(jiǎn)單的功能,全球化(Globalization)浪潮、知識(shí)經(jīng)濟(jì)、基因工程、以及各種嚴(yán)格的行業(yè)規(guī)范(尤其是FDA發(fā)布的關(guān)于電子記錄和電子簽名的新規(guī)范FDA Ruling 21 CFR Part 11),再加上目前正在滲透到全球每個(gè)角落的Internet技術(shù),把LIMS的應(yīng)用推向了一個(gè)前所未有的高度。


20 世紀(jì)70年代末,國(guó)際上出現(xiàn)了第一代LIMS。這些最早出現(xiàn)的LIMS是由各個(gè)實(shí)驗(yàn)室在相關(guān)的計(jì)算機(jī)軟件開(kāi)發(fā)商的幫助下,或者利用自身的技術(shù)力量自行開(kāi)發(fā)的系統(tǒng),即該實(shí)驗(yàn)室的LIMS是專(zhuān)門(mén)為其定做的一套軟件,不能被其他的實(shí)驗(yàn)室所采用。由于這類(lèi)系統(tǒng)在開(kāi)發(fā)之日起就局限于經(jīng)費(fèi)和技術(shù)上的不足,功能較少,軟件升級(jí)和維護(hù)困難,無(wú)法滿(mǎn)足實(shí)驗(yàn)室不斷變化的需求,因此已經(jīng)被商品化的LIMS所逐步取代。這類(lèi)原始的LIMS在歐美國(guó)家已經(jīng)很少見(jiàn)到,但由于中國(guó)國(guó)內(nèi) LIMS技術(shù)與國(guó)際水平的巨大差距,目前這類(lèi)LIMS在國(guó)內(nèi)還會(huì)經(jīng)常見(jiàn)到。國(guó)內(nèi)所有的LIMS軟件開(kāi)發(fā)商為用戶(hù)所提供的LIMS都還屬于這類(lèi)系統(tǒng)。

第二代LIMS最早出現(xiàn)于1982年,是基于終端/服務(wù)器(T/S)或客戶(hù)/服務(wù)器(C/S)結(jié)構(gòu)的商品化軟件,其特點(diǎn)是:用戶(hù)的需求基本都能考慮到,可以滿(mǎn)足實(shí)驗(yàn)室隨時(shí)變化的需求;軟件升級(jí)、技術(shù)支持容易,使用壽命可以很長(zhǎng)。商品化LIMS的出現(xiàn),無(wú)疑為實(shí)驗(yàn)室管理人員帶來(lái)了巨大的方便,但同時(shí)也帶來(lái)了一個(gè)不小的煩惱。原因在于幾乎所有的商品化LIMS在安裝之后都需要作大量的用戶(hù)化(Customization)工作,即編寫(xiě)一些程序滿(mǎn)足用戶(hù)特定的需求,如映射實(shí)驗(yàn)室的工作流程以及聯(lián)結(jié)各種分析儀器等。而且用戶(hù)的這些需求往往是需要經(jīng)常改變的,也就是說(shuō)需要IT專(zhuān)業(yè)人員作為L(zhǎng)IMS用戶(hù)的系統(tǒng)管理員 (System Manager)以隨時(shí)編寫(xiě)相關(guān)程序。由此就帶來(lái)了兩個(gè)問(wèn)題:首先是IT專(zhuān)業(yè)人員的流動(dòng)性很大(國(guó)際上IT人員的平均年流動(dòng)率超過(guò)25%),使得LIMS 系統(tǒng)管理員的穩(wěn)定性不高。因系統(tǒng)管理員的離職而造成LIMS無(wú)法正常運(yùn)行的情況在國(guó)內(nèi)外都是屢見(jiàn)不鮮的;其次是IT出身的系統(tǒng)管理員很難完全理解實(shí)驗(yàn)室運(yùn)作的詳細(xì)機(jī)制,為L(zhǎng)IMS的用戶(hù)化帶來(lái)了一定的難度,尤其是在研發(fā)實(shí)驗(yàn)室(其工作性質(zhì)要求LIMS的工作流程能被科研人員隨時(shí)修改)更是如此。因此,大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室管理人員都希望能有一套不需要IT專(zhuān)業(yè)人員就能完好運(yùn)行的LIMS。

第三代的LIMS出現(xiàn)于1998年,是基于C/S結(jié)構(gòu)的商品化軟件而不需要用戶(hù)編寫(xiě)任何程序。其特點(diǎn)是:LIMS在安裝后不需要用戶(hù)化工作,只需要按照用戶(hù)的具體要求進(jìn)行簡(jiǎn)單的設(shè)置 (Configuration),就可將整個(gè)系統(tǒng)正式投用。在設(shè)置過(guò)程中,用戶(hù)不需要編寫(xiě)任何程序,而只需要進(jìn)行鼠標(biāo)的點(diǎn)擊。任何熟悉Microsoft ® Windows®操作的實(shí)驗(yàn)室工作人員在接受簡(jiǎn)單的培訓(xùn)以后就可完成諸如工作流程的設(shè)計(jì)和儀器聯(lián)結(jié)等工作,并按照實(shí)驗(yàn)室需求的變化隨時(shí)更改系統(tǒng)的設(shè)置。

這第三代的LIMS為實(shí)驗(yàn)室?guī)?lái)了很大的方便,但也還存在某些缺點(diǎn):
1)它是單一服務(wù)器且以局域網(wǎng)為中心的系統(tǒng),所以難以擴(kuò)展至大型企業(yè)的廣域網(wǎng)或部署在Internet上。
2)系統(tǒng)維護(hù)和升級(jí)復(fù)雜,要求較高。作為一套C/S結(jié)構(gòu)的軟件,用戶(hù)必須在客戶(hù)端安裝客戶(hù)端應(yīng)用程序,因此維護(hù)和運(yùn)行成本較高。
3)很多大型集團(tuán)用戶(hù)的實(shí)驗(yàn)室分布在不同的地點(diǎn),甚至不同的國(guó)家,他們希望使用Internet技術(shù)整合整個(gè)集團(tuán)的實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù),但這類(lèi)C/S結(jié)構(gòu)的LIMS基本無(wú)法做到。
4)很多用戶(hù)希望能在家,在旅途等任何能夠訪(fǎng)問(wèn)Internet的地方使用LIMS,甚至使用移動(dòng)電話(huà)和掌上電腦(PDA,即個(gè)人數(shù)字助理)等無(wú)線(xiàn)設(shè)備訪(fǎng)問(wèn)LIMS,而C/S結(jié)構(gòu)的LIMS顯然不能滿(mǎn)足這一要求。

隨著Internet的普及和全球化浪潮的沖擊,對(duì)LIMS的應(yīng)用要求遠(yuǎn)不再局限于局域網(wǎng),越來(lái)越多的用戶(hù)希望能夠在Internet上使用LIMS。因此,在2004年,出現(xiàn)了第四代的LIMS,這是一種完全基于Internet技術(shù)的新產(chǎn)品,其特點(diǎn)是:
1) 基于瀏覽器/服務(wù)器(B/S)結(jié)構(gòu),很容易部署在廣域網(wǎng)和Internet上;對(duì)這種B/S結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)只需要管理好服務(wù)器,客戶(hù)端只采用Internet 瀏覽器,無(wú)需安裝任何LIMS軟件,自然也就無(wú)需維護(hù);無(wú)論用戶(hù)的規(guī)模有多大,有多少分支機(jī)構(gòu)都不會(huì)增加任何維護(hù)升級(jí)的工作量,所有的操作只需要針對(duì)服務(wù)器進(jìn)行。只需要把服務(wù)器連接到Internet,就可實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)程維護(hù)、升級(jí)和數(shù)據(jù)共享。
2)可以容易地利用Internet聯(lián)結(jié)多個(gè)地點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)室。
3)通過(guò)Internet,用戶(hù)可以在家,在旅途等任何一個(gè)有Internet連接的地方使用LIMS,無(wú)限擴(kuò)展了LIMS的適用范圍;
4)支持無(wú)線(xiàn)用戶(hù),即通過(guò)支持WAP(無(wú)線(xiàn)應(yīng)用協(xié)議)使得用戶(hù)可以非常方便地利用移動(dòng)電話(huà)和掌上電腦等無(wú)線(xiàn)設(shè)備隨時(shí)掌握實(shí)驗(yàn)室的信息,這為需要經(jīng)常參加各種會(huì)議的實(shí)驗(yàn)室管理人員提供了極大的方便。




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